这个Numpy双循环的矢量化

时间:2011-11-28 17:35:45

标签: python numpy linear-algebra

如何对以下双循环进行矢量化?

我有一个N乘A矩阵和一个N乘B矩阵,其中A和B可能不同,N比A和B小得多。我想按如下方式生成A by B矩阵,但理想情况下没有循环:

import numpy as np

def foo(arr):
    # can be anything - just an example so that the code runs
    return np.sum(arr)

num_a = 12
num_b = 8
num_dimensions = 3

a = np.random.rand(num_dimensions, num_a)
b = np.random.rand(num_dimensions, num_b)

# this is the loop I want to eliminate:
output = np.zeros( (num_a, num_b) )
for i in xrange(num_a):
    for j in xrange(num_b):
       output[i,j] = foo(a[:,i] - b[:,j])

有什么想法吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:7)

第一个矢量化foo(),即修改foo(),使其能够在形状(N, A, B)的数组上正确操作,返回形状(A, B)的数组。这一步通常是困难的。如何完成这完全取决于foo()的作用。对于给定的示例,它很容易做到:

def foo(arr):
    return np.sum(arr, axis=0)

现在,使用broadcasting rules创建一个包含所有向量差异的(N, A, B)数组,并将其传递给foo()

foo(a[:, :, np.newaxis] - b[:, np.newaxis])
相关问题