感谢JohnnyO，如果可以结合nVidia 3D视觉运行Java3D应用程序，已经回答了问题：
Is it possible to run Java3D applications on Nvidia 3D Vision hardware?
他的方法对我也很好。 但它仅限于全屏模式。
他的线程已经有几个月了，现在在过去的几周里，nVidia改进了3D Vision的驱动程序：现在也可以在窗口模式下运行许多应用程序。如果您使用的是专业硬件，如nVidia Quadro卡或ATI Fire GL，您已经了解并了解窗口模式已有很长时间了。
现在，随着nVidia驱动程序的最新更新（我目前安装了295.73），还可以在窗口模式下运行许多应用程序，如nVidia Picture Viewer，Stereoscopic Player等。
http://nvidia.custhelp.com/app/answers/detail/a_id/2311
正常情况下，DirectX 9应用程序应该以窗口模式运行，您可以在前面提到的nVidia页面上阅读。我认为Java 3D是一个DirectX 9应用程序。如果我使用：
-Dj3d.debug =真
然后控制台说：
[j3d]使用DirectX D3D 9.0或更高版本。
（当然，似乎没有人正在努力改进这些Java 3D的DirectX实现。）
有人同时找到了如何在Stereo窗口模式下运行Java3D的技巧吗？我试过了，但我失败了这么久。我认为如果我们解决这个问题，这将是 pro Java 3D的一个非常重要的论点！
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当我玩这个游戏时，我注意到的一件事是3D视觉驱动程序没有被踢进去，即使我认为我已经正确设置了所有内容。
我们发现的一个黑客是nVidia驱动程序实际上只配置为支持白名单上的特定视频游戏，但白名单匹配仅基于exe名称。
在遇到很多问题和挫折之后，我们将myprogram.exe中的Java包装器重命名为白名单中的东西，事情做得更好。我想有一段时间，或exe在测试中被命名为BatmanAC.exe或类似的东西。这似乎使nVidia驾驶员对我们想做的事情更加宽容。