Question

首先，我不是很精通Java。事实上，我正在使用JLink / Mathematica来做我想做的事。

在我们的实验室中，我们正在使用Mathematica控制的相机拍摄我们的实验照片。我们想将图像显示程序转换为ImageJ。另一个程序是记忆猪，它很慢。

从我的研究中，我可以通过编写插件，脚本或宏来实现这一点。我的印象是，无论我写什么，都会被安装到ImageJ中，并由默认的GUI控制。

我的问题是，我可以编写一个外部程序来控制已经运行的ImageJ实例吗？理想情况下，事件的顺序是。

相机通过已有的脚本捕获图像。
图像捕获脚本要求ImageJ显示捕获的图像以及默认GUI，以便我可以访问默认工具集。
我可以通过默认的GUI执行一些配置文件绘图和直方图。
将图像移交给ImageJ的脚本已关闭，但ImageJ上的图像仍然保留。

我已成功导入ImageJ的ij类并使用它。这是我尝试在ImageJ中创建图片。它位于Mathematica的JLink中，但它可以完全转换为Java。

Needs["JLink`"];
InstallJava[];
AddToClassPath["C:\\Program Files\\ImageJ\\ij.jar"];
ijClass = LoadJavaClass["ij.IJ"];
imagePlusClass = LoadJavaClass["ij.ImagePlus"];
JavaNew[imagePlusClass, "My New Image", 
  JavaNew["ij.process.ByteProcessor", 400, 400]]@show[]
ij`IJ`log["test"];
ij`IJ`getLog[]

然而，创建的图像是在某种Java窗口中。已经运行的imageJ根本不与它交互。此外，我似乎可以使用getLog []来捕获已经运行的ImageJ的日志。

同样，问题是，我可以使用未安装在ImageJ中的外部脚本作为插件，脚本或宏来在已经运行的ImageJ上显示图像吗？或者，我可以使用外部脚本在已经运行的ImageJ实例上调用预安装的宏吗？

Answer 1

您要做的是inter-process communication。 ImageJ有一种将信息传递给正在运行的实例的机制。转到编辑▶选项▶其他...并选中“运行单个实例监听器”框。但是，此功能仅限于命令行参数。因此，您可以通过尝试使用所需的参数启动第二个ImageJ（然后将其传递给正在运行的实例）来告诉正在运行的实例，例如，从磁盘打开图像。但你不能直接通过电线输入像素 - 你必须将它们写入临时文件。

您最简单的选择是通过ImageJ完成所有事情。但是，混合使用Mathematica并不是当前场景中的最简单跳跃。

因此，下一个最简单的事情是从Mathematica启动ImageJ，并始终与ImageJ的同一个实例进行通信以完成所有操作。也许你可以这样做？

如果必须与外部启动的ImageJ实例进行通信，则需要使用上面提到的CLI参数传递方案，或者实现某种类型的own interprocess communication scheme。

控制已存在的ImageJ

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