具有特定名称的列的行方式总和

时间:2016-02-29 07:18:34

标签: r sum

我有一个示例数据:

SampleID  a      b     d     f       ca      k     l    cb
1         0.1    2     1     2       7       1     4    3
2         0.2    3     2     3       4       2     5    5
3         0.5    4     3     6       1       3     9    2

我需要找到列的行总和,这些列在名称中有一些共同之处,例如:行式sum(a, ca)或行式sum(b,cb)。问题是我有大量的data.frame,理想情况下我可以编写列标题中常见的内容,因此代码只会选择那些列来进行求和

预先感谢您的任何帮助。

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

我们可以选择包含grep的'a'的列,对列进行分组并执行rowSums,并使用'b'列进行选择。

 rowSums(df1[grep('a', names(df1)[-1])+1])
 rowSums(df1[grep('b', names(df1)[-1])+1])

答案 1 :(得分:0)

如果您想将输出作为数据框,请尝试使用dplyr

# Recreating your sample data
df <- data.frame(SampleID = c(1, 2, 3),
             a = c(0.1, 0.2, 0.5),
             b = c(2, 3, 4),
             d = c(1, 2, 3),
             f = c(2, 3, 6),
             ca = c(7, 4, 1),
             k = c(1, 2, 3),
             l = c(4, 5, 9),
             cb = c(3, 5, 2)) 

处理数据

# load dplyr
library(dplyr)

# Sum across columns 'a' and 'ca' (sum(a, ca))
df2 <- df %>%
    select(contains('a'), -SampleID) %>% # 'select' function to choose the columns you want 
    mutate(row_sum = rowSums(.)) # 'mutate' function to create a new column 'row_sum' with the sum of the selected columns. You can drop the selected columns by using 'transmute' instead.

df2 # have a look

    a ca row_sum
1 0.1  7     7.1
2 0.2  4     4.2
3 0.5  1     1.5