好的，我们走了...... 我正在尝试在Windows 10上安装pygraphviz。这个问题在网上有很多解决方案，但没有一个对我有用。我遇到的确切问题是通过jupyter笔记本 - ＆gt;
[1] import networkx as nx
import pylab as plt
from networkx.drawing.nx_agraph import graphviz_layout
[2]G = nx.DiGraph()
G.add_node(1,level=1)
G.add_node(2,level=2)
G.add_node(3,level=2)
G.add_node(4,level=3)
G.add_edge(1,2)
G.add_edge(1,3)
G.add_edge(2,4)
nx.draw(G, pos=graphviz_layout(G), node_size=1600, cmap=plt.cm.Blues,
node_color=range(len(G)),
prog='dot')
plt.show()
我在[2]之后得到以下错误：
ModuleNotFoundError Traceback (most recent call last)
C:\Users\name\Anaconda3\lib\site-packages\networkx\drawing\nx_agraph.py
in
pygraphviz_layout(G, prog, root, args)
254 try:
--> 255 import pygraphviz
256 except ImportError:
ModuleNotFoundError: No module named 'pygraphviz'
和
ImportError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-2-86a15892f0f0> in <module>()
9 G.add_edge(2,4)
10
---> 11 nx.draw(G, pos=graphviz_layout(G), node_size=1600, cmap=plt.cm.Blues,
12 node_color=range(len(G)),
13 prog='dot')
C:\Users\name\Anaconda3\lib\site-packages\networkx\drawing\nx_agraph.py in graphviz_layout(G, prog, root, args)
226
227 """
--> 228 return pygraphviz_layout(G,prog=prog,root=root,args=args)
229
230 def pygraphviz_layout(G,prog='neato',root=None, args=''):
C:\Users\name\Anaconda3\lib\site-packages\networkx\drawing\nx_agraph.py in pygraphviz_layout(G, prog, root, args)
256 except ImportError:
257 raise ImportError('requires pygraphviz ',
--> 258 'http://pygraphviz.github.io/')
259 if root is not None:
260 args+="-Groot=%s"%root
ImportError: ('requires pygraphviz ', 'http://pygraphviz.github.io/')
以下是我试图解决的问题
（1）常规pip安装：“pip install pygraphviz”这是我最后得到的错误。 编辑即使我以管理员身份运行cmd，也会收到相同的错误。
Command "C:\Users\name\Anaconda3\python.exe -u -c "import setuptools,
tokenize;__file__='C:\\Users\\name~1\\AppData\\Local\\Temp\\pip-build-
n81lykqs\\pygraphviz\\setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)
(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code,
__file__, 'exec'))" install --record C:\Users\name~1\AppData\Local\Temp\pip-
b3jz1lk5-record\install-record.txt --single-version-externally-managed --
compile" failed with error code 1 in C:\Users\name~1\AppData\Local\Temp\pip-
build-n81lykqs\pygraphviz\
（2）下载并安装graphviz-2.38.msi，然后下载64位版本的滚轮。这是结果。
C:\Users\name\Anaconda3>pip install pygraphviz-1.3.1-cp34-none-
win_amd64.whl
pygraphviz-1.3.1-cp34-none-win_amd64.whl is not a supported wheel on this
platform.
C:\Users\name\Anaconda3>pip install pygraphviz-1.3.1-cp27-none-
win_amd64.whl
pygraphviz-1.3.1-cp27-none-win_amd64.whl is not a supported wheel on this
platform.
我想尝试一下，但不确定如何正确行事：
修改setup.py。我已经阅读了很多关于人们在改变路径时找到解决方案的内容，但我不确定如何做到这一点。这种方法看起来非常复杂。
感谢您的帮助/见解！
答案 0 :(得分：6)
投票最多的答案似乎是安装graphviz，而不是pygraphviz。
如果您使用的是conda环境，则可以尝试使用此频道：
conda install graphviz pygraphviz -c alubbock
我用networkx 2.1进行了试用，效果很好。
答案 1 :(得分：5)
更新了存储库： [GitHub]: CristiFati/Prebuilt-Binaries - (master) Prebuilt-Binaries/Windows/PyGraphviz 。
为 Python 添加了 .whl （ win_amd64 ， win32 ） ：
对于 Python 2.7 ，它们已经构建：[UCI.LFD]: Unofficial Windows Binaries for Python Extension Packages - PyGraphviz, an interface to the Graphviz graph layout and visualization package.。
注释：
任何想了解有关构建过程的更多详细信息的人，继续阅读！
将近2年后，问题仍然存在（当然，与问题不完全相同）。
我首先要强调两个软件包之间的区别：
在 Anaconda 环境中，[SO]: Installing PyGraphviz on Windows 10 64-bit, Python 3.6 (@TomHanks's answer) 完美运行。
pygraphwiz 仅可用于下载存档文件（在这种情况下为 .zip ），这意味着该文件包含（ C / < em> C ++ ）源。
关于软件包（ .whl s）的几句话，其名称包含诸如 cp34-none-win_amd64 之类的内容（选中{{3 }}以获取详细信息）：
现在，许多软件包已经为运行在各种 OS es（例如[SO]: What does version name 'cp27' or 'cp35' mean in Python? (@WayneWerner's answer)）上的大多数常见 Python 版本预先构建了二进制文件，但是有许多软件包没有，并且仅包含来源。不幸的是， PyGraphviz 位于2 nd 类别中。对于后者，pip install将：
作为旁注： pip -v ...为当前命令启用 verbose 模式，当遇到安装错误时该模式非常方便。
回到我们的问题： Python 3.6 需要 VStudio 2015 （[PyPI]: mysql-connector-python - Download files）。
这是一个非常广阔的话题，我在以下内容中做了介绍：
您应该在继续操作之前检查它们，并保持它们处于打开状态，因为在接下来的步骤中肯定会需要它们。
我已经安装了 VStudio 2015社区（在许多其他版本中），您也应该安装它，它是免费的（[SO]: How to build a DLL version of libjpeg 9b? (@CristiFati's answer)）。
PyGraphviz 取决于[MS.VStudio]: Still want an older version?。因此，在构建时，将需要已经构建 Graphviz （的一部分）（还具有其他依赖项）。不幸的是，我找不到预构建的二进制文件（有[Graphviz]: Graph Visualization Software，但无济于事），因此必须手动构建。
进一步操作之前：
[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_03.06.08_test0\Scripts\python.exe" -c "import pygraphviz" Traceback (most recent call last): File "<string>", line 1, in <module> ModuleNotFoundError: No module named 'pygraphviz' [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> dir /b other src
这是我的 顶部目录 ，所有源均已下载到 src 目录中，二进制文件将放置在 bin < / em>目录。
在开始之前，我想提一下，我非常依赖[Graphviz]: Windows Packages - graphviz-2.38.zip（您不必这样做），并且我的一些工具已安装在其中，因此我将在 Cygwin < / em>和 cmd 终端（可能会造成混淆）。
Cygwin状态：
在Windows上构建：
（Graphviz版本≥2.41）
首先，在存储库的根目录中，执行git子模块更新--init。这将下载所有子模块，其中大部分是Windows构建的依赖项。接下来，将windows \ dependencies \ graphviz-build-utilities目录添加到PATH（然后重新启动Visual Studio或在其后执行msbuild的提示）。该文件夹包含工具Bison，Flex和SED（以及将来的附加产品）以及经过测试的版本。如果一切顺利，现在就可以建立依赖关系，您可以构建Graphviz。
首先，我们需要下载所有内容：
[cfati@cfati-5510-0:/cygdrive/e/Work/Dev/StackOverflow/q045093811/src/graphviz]> git clone https://gitlab.com/graphviz/graphviz.git . Cloning into '.'... remote: Enumerating objects: 71728, done. remote: Counting objects: 100% (71728/71728), done. remote: Compressing objects: 100% (19331/19331), done. remote: Total 71728 (delta 52200), reused 71681 (delta 52157) Receiving objects: 100% (71728/71728), 163.79 MiB | 480.00 KiB/s, done. Resolving deltas: 100% (52200/52200), done. Checking out files: 100% (3870/3870), done. [cfati@cfati-5510-0:/cygdrive/e/Work/Dev/StackOverflow/q045093811/src/graphviz]> git submodule update --init Submodule 'dependencies/criterion' (https://github.com/Snaipe/Criterion.git) registered for path 'dependencies/criterion' Submodule 'windows/dependencies/graphviz-build-utilities' (https://github.com/ErwinJanssen/graphviz-build-utilities.git) registered for path 'windows/dependencies/graphviz-build-utilities' Submodule 'windows/dependencies/libraries' (https://github.com/ErwinJanssen/graphviz-windows-dependencies.git) registered for path 'windows/dependencies/libraries' Cloning into '/cygdrive/e/Work/Dev/StackOverflow/q045093811/src/graphviz/dependencies/criterion'... Cloning into '/cygdrive/e/Work/Dev/StackOverflow/q045093811/src/graphviz/windows/dependencies/graphviz-build-utilities'... Cloning into '/cygdrive/e/Work/Dev/StackOverflow/q045093811/src/graphviz/windows/dependencies/libraries'... Submodule path 'dependencies/criterion': checked out '301d143ea42c024f22b673b69c72a4cb3c8d151f' Submodule path 'windows/dependencies/graphviz-build-utilities': checked out '050fff84ce195e0740878748760fd801eeb07b23' Submodule path 'windows/dependencies/libraries': checked out '141d3a21be904fa8dc2ae3ed01d36684db07a35d' [cfati@cfati-5510-0:/cygdrive/e/Work/Dev/StackOverflow/q045093811/src/graphviz]> git show head commit 89292b5945933b1501293c04894ed9cf886241be (HEAD -> master, origin/master, origin/HEAD) Merge: 429d43615 97811bd35 Author: Stephen C North <scnorth@gmail.com> Date: Mon Feb 4 08:09:40 2019 -0500 Merge branch 'wasbridge/graphviz-master' into HEAD [cfati@cfati-5510-0:/cygdrive/e/Work/Dev/StackOverflow/q045093811/src/graphviz]> git status On branch master Your branch is up to date with 'origin/master'. nothing to commit, working tree clean
您最终将看到一个包含〜320 MiB 内容的目录。该目录包含 graphviz.sln 文件，该文件是 VStudio（2015）解决方案文件，其中包含 63 项目
查看 Anaconda 或 Python 2.7 pygraphviz （内置）软件包，它仅取决于 cgraph.dll ，这又取决于 cdt.dll ，因此只有两个项目与我们相关。请注意，这两个项目可能不需要所有的 git 子模块（因此目录可能会被删减），但我没有做进一步的研究。
不幸的是，项目仅配置为 32位（ Win32 平台）。必须手动添加 64位（我是从 VStudio IDE 完成的-并在我引用的答案之一中描述了该过程） ）。保存项目后，它们将被显示为 git ：
[cfati@cfati-5510-0:/cygdrive/e/Work/Dev/StackOverflow/q045093811/src/graphviz]> git status On branch master Your branch is up to date with 'origin/master'. Changes not staged for commit: (use "git add <file>..." to update what will be committed) (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory) (commit or discard the untracked or modified content in submodules) modified: lib/cdt/cdt.vcxproj modified: lib/cgraph/cgraph.vcxproj modified: windows/dependencies/graphviz-build-utilities (modified content) no changes added to commit (use "git add" and/or "git commit -a")
第3 rd 项是因为我需要重置2个可执行文件的某些安全权限（在构建 cgraph 时使用）：
设置不正确（很可能是由于 Cygwin ）。
您可以从 IDE 构建2个项目，但是我选择了命令行（[Graphviz]: Graphviz Build Instructions for Windows），因为我觉得它更灵活：
[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> "c:\Install\x86\Microsoft\Visual Studio Community\2015\vc\vcvarsall.bat" x64 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> set PATH=%PATH%;%CD%\src\graphviz\windows\dependencies\graphviz-build-utilities [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> msbuild src\graphviz\lib\cdt\cdt.vcxproj /t:Rebuild /p:Platform=x64;Configuration=Release;SolutionDir=%CD%\src\graphviz\;OutDir=%CD%\bin\Win\dynamic\064\UCRTv140\md\Release\graphviz\ >build_cdt_064.txt 2>&1 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> echo %errorlevel% 0 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> dir /b bin build_cdt.txt other src [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> msbuild src\graphviz\lib\cgraph\cgraph.vcxproj /t:Rebuild /p:Platform=x64;Configuration=Release;SolutionDir=%CD%\src\graphviz\;OutDir=%CD%\bin\Win\dynamic\064\UCRTv140\md\Release\graphviz\ >build_cgraph_064.txt 2>&1 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> echo %errorlevel% 0 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> dir /b "bin\Win\dynamic\064\UCRTv140\md\Release\graphviz" cdt.dll cdt.dll.lastcodeanalysissucceeded cdt.exp cdt.lib cgraph.dll cgraph.dll.lastcodeanalysissucceeded cgraph.exp cgraph.lib
因此，我们拥有所需的所有内容（2个 .lib 和2个 .dll 文件）以继续。
PyGraphviz 源（从[Ms.Docs]: MSBuild command-line reference下载）并解压缩为 src / pygraphviz / pygraphviz-pygraphviz-1.5 。
需要对 Graphviz 进行进一步的调整（可能是作为另一个项目的一部分完成的-一个 install 步骤）：准备头文件：
[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> mkdir include\graphviz [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> copy src\graphviz\lib\cdt\cdt.h include\graphviz 1 file(s) copied. [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> copy src\graphviz\lib\cgraph\cgraph.h include\graphviz 1 file(s) copied.
不幸的是，由于[GitHub]: pygraphviz/pygraphviz - (pygraphviz-1.5) pygraphviz-pygraphviz-1.5.zip， PyGraphviz 不会不构建 OOTB 。要解决此问题，必须应用[GitHub]: pygraphviz/pygraphviz - Python 3 support。我对其进行了修改以使其与当前的源一起使用（因为它对 OOTB 不起作用，也仅对 graphviz_wrap.cpp 有用：X（） ：
pygraphviz-1.5-all-pyiobase_b85d12ac22d39063f7dbcc396e825c563431e352.patch ：
--- pygraphviz/graphviz_wrap.c.orig 2018-09-10 16:07:12.000000000 +0300
+++ pygraphviz/graphviz_wrap.c 2019-02-26 18:05:20.281741400 +0200
@@ -2988,7 +2988,18 @@
#if PY_VERSION_HEX >= 0x03000000
-extern PyTypeObject PyIOBase_Type;
+static PyObject *PyIOBase_TypeObj;
+
+static int init_file_emulator(void)
+{
+ PyObject *io = PyImport_ImportModule("_io");
+ if (io == NULL)
+ return -1;
+ PyIOBase_TypeObj = PyObject_GetAttrString(io, "_IOBase");
+ if (PyIOBase_TypeObj == NULL)
+ return -1;
+ return 0;
+}
#endif
@@ -3449,7 +3460,7 @@
{
#if PY_VERSION_HEX >= 0x03000000 || defined(PYPY_VERSION)
#if !defined(PYPY_VERSION)
- if (!PyObject_IsInstance(obj0, (PyObject *)&PyIOBase_Type)) {
+ if (!PyObject_IsInstance(obj0, PyIOBase_TypeObj)) {
PyErr_SetString(PyExc_TypeError, "not a file handle");
return NULL;
}
@@ -3523,7 +3534,7 @@
{
#if PY_VERSION_HEX >= 0x03000000 || defined(PYPY_VERSION)
#if !defined(PYPY_VERSION)
- if (!PyObject_IsInstance(obj1, (PyObject *)&PyIOBase_Type)) {
+ if (!PyObject_IsInstance(obj1, PyIOBase_TypeObj)) {
PyErr_SetString(PyExc_TypeError, "not a file handle");
return NULL;
}
@@ -6051,6 +6062,12 @@
SWIG_InstallConstants(d,swig_const_table);
+#if PY_VERSION_HEX >= 0x03000000
+ if (init_file_emulator() < 0) {
+ return NULL;
+ }
+#endif
+
PyDict_SetItemString(md,(char*)"cvar", SWIG_globals());
SWIG_addvarlink(SWIG_globals(),(char*)"Agdirected",Swig_var_Agdirected_get, Swig_var_Agdirected_set);
SWIG_addvarlink(SWIG_globals(),(char*)"Agstrictdirected",Swig_var_Agstrictdirected_get, Swig_var_Agstrictdirected_set);
那是一个 diff （ patch ）。请参阅[GitHub]: eendebakpt/pygraphviz - Workaround for PyIOBase_Type for Python2 on win（修补 utrunner 部分），了解如何在 Win 上应用补丁（基本上，每行以开头）一个“ +” 符号进入，以一个“-” 符号开头的每一行都消失）。
[cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> set _TOP_DIR=%CD% [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> pushd src\pygraphviz\pygraphviz-pygraphviz-1.5 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811\src\pygraphviz\pygraphviz-pygraphviz-1.5]> pushd pygraphviz && "c:\Install\x64\Cygwin\Cygwin\AllVers\bin\patch.exe" -p 1 -buNi ..\pygraphviz-1.5-all-pyiobase_b85d12ac22d39063f7dbcc396e825c563431e352.patch && popd patching file graphviz_wrap.c [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811\src\pygraphviz\pygraphviz-pygraphviz-1.5]> echo %errorlevel% 0 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811\src\pygraphviz\pygraphviz-pygraphviz-1.5]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_03.06.08_test0\Scripts\python.exe" setup.py install --include-path=%_TOP_DIR%\include --library-path=%_TOP_DIR%\bin\Win\dynamic\064\UCRTv140\md\Release\graphviz >%_TOP_DIR%\install_pygraphviz_064.txt 2>&1 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811\src\pygraphviz\pygraphviz-pygraphviz-1.5]> echo %errorlevel% 0 [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811\src\pygraphviz\pygraphviz-pygraphviz-1.5]> popd [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> set PATH=%PATH%;%CD%\bin\Win\dynamic\064\UCRTv140\md\Release\graphviz [cfati@CFATI-5510-0:e:\Work\Dev\StackOverflow\q045093811]> "e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_03.06.08_test0\Scripts\python.exe" -c "import pygraphviz;print(dir(pygraphviz), \"\n\", pygraphviz.graphviz._graphviz)" ['AGraph', 'Attribute', 'DotError', 'Edge', 'ItemAttribute', 'Node', '__all__', '__author__', '__builtins__', '__cached__', '__date__', '__doc__', '__file__', '__license__', '__loader__', '__name__', '__package__', '__path__', '__revision__', '__spec__', '__version__', 'absolute_import', 'agraph', 'division', 'graphviz', 'print_function', 'release', 'test', 'tests', 'version'] <module '_graphviz' (e:\Work\Dev\VEnvs\py_064_03.06.08_test0\lib\site-packages\pygraphviz\_graphviz.cp36-win_amd64.pyd)>
如图所示，模块已成功导入。
请注意，导入模块时，必须有2个 .dll 依赖项（来自上一节），因此它们的目录已添加到％PATH％中。
当然，这只是（lam）解决方法（ gainarie ），这种情况不会在每次必须使用该程序包时发生。
我还不知道如何指示 setup.py 将它们也复制到包build / install dir中，因此作为一种替代方法（也是解决方法），必须手动复制它们在 pygraphviz 中安装目录（ _graphviz.cp36-win_amd64.pyd 旁边，在我的情况下为：“ e： \ Work \ Dev \ VEnvs \ py_064_03.06.08_test0 \ lib \ site-packages \ pygraphviz“ ）。
由于整个过程很复杂，需要大量的人工干预和修改，因此，我设法（对 setup.py 进行了少量修改）构建了（ wheel ）包。
我不知道有一种简单的方法可以将其公开发布，因此（尽管我知道这是一种不好的做法），我将其上传到了[SO]: Run/Debug a Django application's UnitTests from the mouse right click context menu in PyCharm Community Edition? (@CristiFati's answer)。
您可以下载它，然后像这样安装（这是一种方法）：
"C:\Path\to\Python-3.6-amd64\pip" install "C:\Path\to\downloaded\pygraphviz-1.5-cp36-cp36m-win_amd64.whl"
注意：它也适用于 Anaconda 环境！
答案 2 :(得分：2)
在Windows 10 64位和Python 3.6上解决了它。
<强>步骤：
C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin。安装graphviz滚轮。
pip install graphviz-0.8.3-py2.py3-none-any.whl
完成！
答案 3 :(得分：-1)
这对我有用：
C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin添加到PATH环境变量中。 conda create --name digraphs python=3.4 anaconda。activate digraphs。pip install pygraphviz-1.3.1-cp34-none-win_amd64.whl。python ./gviz_simple.py。deactivate 我在github上添加了一些内容。它很乱，使用风险自负： https://github.com/darkhipo/Easy-Digraph-Draw