R中神经网络包的错误

时间:2017-12-16 15:05:42

标签: r neural-network

我正在尝试使用R中可用于“虹膜”数据集的“神经网络”包实现一个简单的多层前馈神经网络。

我使用的代码如下 -

library(neuralnet)
data(iris)

D <- data.frame(iris, stringsAsFactors=TRUE)

# create formula-
f <- as.formula(Species ~ Sepal.Length + Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width)

# convert qualitative variables to dummy (binary) variables-
m <- model.matrix(f, data = D)

# create neural network-
iris_nn <- neuralnet(f, data = m, hidden = 4, learningrate = 0.3)

此时我有两个问题 -

1.。)如何使用“隐藏”参数?根据手册页,其说 -

hidden:一个整数向量,指定每个层中隐藏神经元(顶点)的数量

我应该如何提供整数向量?如果我想在每层中有1个隐藏的4个神经元/感知器层,或者如果我想在每个层中拥有3个隐藏的5个神经元层,那就说。

2。)最后一行代码给出了错误 -

  

eval中的错误(predvars,data,env):找不到对象'Species'

如果我删除“隐藏”参数,则此错误仍然存​​在。

我在这里做错了什么?

编辑:添加行后 -

m <- model.matrix(f, data = D)

矩阵'm'不再包含我试图预测的“物种”变量/属性。

的输出
str(D)
  

str(D)'data.frame':150 obs。 5个变量:$ Sepal.Length:num   5.1 4.9 4.7 4.6 5 5.4 4.6 5 4.4 4.9 ... $ Sepal.Width:num 3.5 3 3.2 3.1 3.6 3.9 3.4 3.4 2.9 3.1 ... $ Petal.Length:num 1.4 1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5 .. 。$ Petal.Width:num 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.4 0.3 0.2 0.2 0.1 ... $种类:因子w / 3级“setosa”,“versicolor”,..:1 1 1 1 1 1 1 1 1 1。 ..

我已成功用“nnet”编码。发布我的代码以供参考 -

data(iris)
library(nnet)

# create formula-
f <- as.formula(Species ~ Sepal.Length + Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width)

# create a NN with hidden layer having 4 neurons/node and
# maximum number of iterations = 3
iris_nn <- nnet(f, data = iris, size = 4, maxit = 3)

# create a test data-
new_obs <- data.frame(Sepal.Length = 5.5, Sepal.Width = 3.1, Petal.Length = 1.4, Petal.Width = 0.4)

# make prediction-
predict(iris_nn, new_obs)   # gives percentage of which class it may belong
predict(iris_nn, new_obs, type = "class")   # gives the class instead of percentages of which 'class' this data type may belong to


# create a 'confusion matrix' to measure accuracy of model-
# rows are actual values and columns are predicted values-
# table(iris$Species, predict(iris_nn, iris[, 1:4], type = "class"))
cat("\n\nConfusion Matrix for # of iters = 3\n")
print(table(iris$Species, predict(iris_nn, iris[, 1:4], type = "class")))
cat("\n\n")

rm(iris_nn)

# setting 'maxit' to 1000, makes the model coverge-
iris_nn <- nnet(f, data = iris, size = 4, maxit = 1000)

# create a new confusion matrix to check model accuracy again-
cat("\n\nConfusion Matrix for # of iters = 1000\n")
print(table(iris$Species, predict(iris_nn, iris[, 1:4], type = "class")))
# table(iris$Species, predict(iris_nn, iris[, 1:4], type = "class"))


# to plot 'iris_nn' trained NN-
# library("NeuralNetTools")
# plotnet(iris_nn)

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

不知道NN如何运行以及运行它的最佳方式是什么。不太了解虹膜数据集。

只是指出它没有运行的原因 - 列Species

str(d)
'data.frame':   150 obs. of  5 variables:
 $ Sepal.Length: num  5.1 4.9 4.7 4.6 5 5.4 4.6 5 4.4 4.9 ...
 $ Sepal.Width : num  3.5 3 3.2 3.1 3.6 3.9 3.4 3.4 2.9 3.1 ...
 $ Petal.Length: num  1.4 1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5 ...
 $ Petal.Width : num  0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.4 0.3 0.2 0.2 0.1 ...
 $ Species     : Factor w/ 3 levels "setosa","versicolor",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...

Species是NN不考虑因素的因素。

转换为虚拟变量 -

d$set <-0
d$set[d$Species == "setosa"] <- 1

d$versi <-0 
d$versi[d$Species == "versicolor"] <- 1



f <- as.formula(set+versi ~ Sepal.Length + Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width)

iris_nn <- neuralnet(f, data = d, hidden = 4, learningrate = 0.3)

编辑:

所以当你说hidden = c(5,3)时 然后神经网络图将有你的输入节点,5个并排隐藏节点(一个层),3个并排隐藏节点(另一个层),输出节点/节点

不知道它们如何影响准确性。

compute的{​​{1}}就像预测所有其他机器学习模型一样。

neuralnet