映射节点大小并在cytoscape网络中添加图例

Question

我在python中使用networkx包来构建多个网络，其中每个网络代表一个生物实验。然后我将这些网络导出为gml文件，以便在cytoscape中进行可视化并进行比较。在每个文件中，我有两个节点属性 - 即计数和颜色。在cytoscape中，我将节点大小分配给它的计数。但是，节点数量之间存在巨大差异，例如，一些节点数量为100，而其他节点数量为50,000。我想将所有cytoscape网络中所有节点的大小映射到一个比例，并且还有一个表示相对大小的图例。下面的图像右侧显示了一个示例！我希望你能帮助我！

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Answer 1

问题第一部分的答案是构建一个log（count）列。这应该为您提供更好的范围来映射到节点大小。

最好的＆＃39;运输＆＃39;在名为“创建传奇...”的命令中创建图例的解决方案在样式控制面板弹出菜单中找到。这导出了一个图形文件，但没有做足够的工作。我正在开发一款名为Legend Creator的应用程序，该应用程序会在画布中为图例添加注释。它正在github / cytoscape repo上开发。