snakemake --list-code-changes不会传播到子工作流中

时间:2018-10-11 07:20:44

标签: snakemake

我使用

't' is a variable but is used like a type

重新运行代码已更改的规则。但是,在使用子工作流时,这似乎不起作用,例如:

主要Snakefile:

snakemake -R `snakemake --list-code-changes`

子工作流Snakefile:

rule all:
  input: "out"

subworkflow subworkflow:
  workdir: "subworkflow"

rule run_subworkflow:
  input: subworkflow("subworkflow_output")
  output: "out"
  shell: "cat {input} > {output}"

未检测到子工作流的shell命令中所做的更改。

这是预期的行为吗?

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